生物知识个人分享

一生想做浪漫极客

23andme、gsa、wegene各染色体位点统计

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shell还没入门，确切的说是还没学，用python3写了个小脚本统计23andme、gsa、wegene各染色体位点. 代码如下： 23andme: gsa的同上，稍做一两处调整。 wegene的没有源数据，找的生信菜鸟团jimmy的shell ` cut -f 2 jimmy_wegene.txt | unique -c |grep -v “^#” `` 结果分析 从图中可...

Posted by zd200572 on July 20, 2017

RNAseq实际操作（实战）

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RNAseq实际操作（实战） 首先声明，虽然是实战，但是其实是学习笔记而已，初学，参考了大量大神的博客和帖子,还有大神引用的大牛的帖子,参考列表见最后。 1、软件安装 1.1 硬件系统情况 系统：BioLinux8（ubuntu14.04.2-x64） 吐槽个一下这个系统，普通帐户竟然环境变量错误（source ~/.bashrc)，对我等小白来说实在头大，只有用root用户运行了。 ...

Posted by zd200572 on July 15, 2017

我的2017书单1（持续更新中)

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2017年已经过半，继续更新自己的书单 1、騎驴找马 徐小平老师的又一本书，主要讲考研还是工作的，书中的一个个案例，告诉我们应该继续进修还是工作中提升自己。虽然已经过了那个年纪，还是想要在以后的工作生活中提升自己。有人用騎驴找马这个词来比喻找工作时不要裸辞，感觉有道理的。 2、Raspberry Pi：Python 编程入门 这是一本树莓派的入门书，树莓派的用处挺大的，但是我的树莓派只充当过...

Posted by zd200572 on July 11, 2017

这次，我还是挺乐视

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#这次，我还是挺乐视 从风光无限每天开发布会，到现在每天负面新闻缠身，仿佛每一个都可能是压挎乐视的最后一根稻草。而乐视，也由当初的每天有乐粉追随，到今天墙倒众人推，没有人认可乐视了。 但是，我们也看到，乐视，还是受到了蔚蓝汽车李想，以及京东刘强东的力挺。我，和他们一样，还是挺乐视。因为乐视还有lucid电动车公司的股票，价值几亿美元，这是一次成功的投资，还有酷派的资产，TCL的股份，还有乐...

Posted by zd200572 on July 10, 2017

我的2016书单

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2016年早已远去，补上我的阅读书单。由于读书水平不高，读书较慢，有记录的，能记下的，还没有突破20本（为大概也就是全部了，除了工作中读的）。记录如下，与大家分享： 1、35岁之前要有的33个梦想 这是一个日本人写的书，读起来感觉和中国人的书没有多大差别，讲的有的梦想还是需要实践一下的。 2、毕业5年决定你的一生 讲职场的书，主要说的是年轻人要有的工作态度和方法。但是，这种号称“畅销...

Posted by zd200572 on July 9, 2017

RNA-seq分析-学习笔记

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RNA-seq分析-学习笔记 从南京图书馆借了本《生物信息学最佳实践》（冉隆科. 生物信息学最佳实践[M]. 科学出版社, 2016.），前几章的笔记记在了纸质笔记本上，感觉还是电子版的可以更便携，刚好一本笔记本记完了，剩下的简略的笔记就记在这里了。 一、分析流程(pipeline) 测序(.fastq)——Bowtie/TopHat(.fa)(read alignment)——Cuf...

Posted by zd200572 on July 9, 2017

欢迎到我的博客

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欢迎到我的博客 今天，我的博客正式上线了，费了好大的劲，终于让github Pages 工作正常了，还专门注册了一个两年前的域名，曾经一度被赌博网站占用的域名。 我要好好利用我的域名和网站，努力创造属于自己的影响力！

Posted by zd200572 on July 6, 2017

省内存软件推荐

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2g小内存xp系统老古董电脑软件推荐 时间已经进入2017年，不少朋友的几年前的旧电脑仍在服役，体验肯定不咋的。硬件还是那个硬件，但是，今天的qq、wps、浏览器、游戏等软件越来越大，直接导致电脑硬件的不足。在这里，推荐几款我正在使用的小内存占用软件给大家，希望可以加速你的电脑。 ​##1、WPS/office 2003 ​或者2007 精简安装或免安装版​​​ 如果你喜欢WPS，用旧...

Posted by zd200572 on July 6, 2017

Rosalind-18-ORF answer

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#欢迎到我的博客# 最近已经基本上学完了《Python生物信息学数据管理（Managing your Biological Data with Python)》，之前学了一点rosalind（生物信息学练习python的好网站。http://rosalind.info/problems/locations/）的内容，现在继续学习下去。 这是第18题的解答。 ’ Open Reading...

Posted by zd200572 on July 6, 2017

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