学习内容列表

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Posted by zd200572 on November 19, 2017

一、生信技能树

1.wgene和WGS的区别

2.PATH,软件安装

二、测序中国探基平台

1.HPO

2.肿瘤信息学入门

3.精准医学中的精准捕获

4.生物大数据、精准医学和机器学习

5.深度学习的实体与病患表示

6.药物基因组与精准药物治疗

7.DNA测序技术的发展

8.三代测序临床

9.CNV、Small lndel与二代测序

10.SNV、SV(凌少平)

11. HiC(北大-李程)

12.Linux基本命令及基因组分析软件

13.R和Bioconductor(曹丽华)

14.癌症转录组(北大-唐泽方)

15.ceRNA分析策略

16.60年从基因组到精准医疗

17.液体活检(元码–田梗)

18.三代测序组装

19.循环肿瘤细胞–液体活检

20.ctDNA–早期肺癌

21.液体活检 精准分析

三、作物育种生物信息学

1.高能量数据管理系统 awk

2.PacBio三代测序

3.HiC辅助组装

4.RNA-Seq(付玉华)Linux软件安装

5.差异表达分析与功能注释

6.重测序

7.三代测序全长转录组(有参-刘丹妮,无参-王茜)

8.三代宏基因组(王欢)

9.PacBio de nova

10.PacBio微生物完成图

11.三代survey(王誉)

12.三代重测序

13.CHIP-Seq

14.三维基因组

四、图书

1.Github入门

2.R语言

3.新一代基因组测序技术

4.Python生物信息学数据管理

5.生物信息学实践

6.生物信息学最佳实践

7.魔法Python

8.生信最佳实践

五、清华BI培训(RNAseq和R语言)

六、Python in Genomics Data

七、生信者言

1.微生物多样性分析

2.三招搞定微生物群落分析(许续)

3.生态类样本微生物多样性分析

八、Dr医学方

1.NGS助力肺癌个性化治疗

2.轨道阱质HT代谢组(刘晓蕙)

3.ddPCR及其在液态活检中的应用

4.肿瘤突变负荷及其在CHK POINT治疗的应用

5.IDT rhAmp SNP (Yun Yao)

6.IDT独特接头解决样本串扰(纳昂达)

7.Oxford NanoPore(陈华昌)

8.数字PCR

九、基因帮

1.lncRNA(庄振华)

十、Agilent

1.NGS各环节质控(何柏芳)

2.2200培训(王培源)

十一、WES基因检测与解读(周在威–游侠)

十二、Illumina

1.Enrichment Sequencing

十三、微生态

1.菌群16S代谢功能预测PICRUST

2.LEfSe和STAMP

十六、Crab Stat

1.UCSC

2.生信入门

十七、GeneK–Bioconda

十八、百迈客–GWAS

十九、陈巍学基因、陈巍翻译 Python