还是科研狗R绘图学习小组的内容，由于尝试加入没有成功，决定跟着学，因为他们在做一些有趣的实用的事情，即使收集代码，稍微改下就能直接使用，很有价值。
http://group.keyangou.com/RGraph
第二部分：R语言文本分析及数据分析应用
R语言访问Pubmed接口获得2016年CELL杂志发表文章数据
R语言将所获数据存储在mysql数据库
R语言读取mysql数据文件进行分词并存储
R语言绘制CELL词汇云
R语言对CELL词汇进行自定义分析
R语言中文分词
R语言获得5000本期刊近5年的影响因子以及绘图
R语言找出5000本期刊中影响因子上升最快前10名和下降最快前10名以及最稳定的前10名
#任务1
library(RMySQL)
#数据库连接删除函数，每个任务之前最好先清理所有的连接，调用此函数就可以
killDbConnections <- function () {
all_cons <- dbListConnections(MySQL())
print(all_cons)
for(con in all_cons)
+ dbDisconnect(con)
print(paste(length(all_cons), " connections killed."))
}#依旧是那个可以清理与数据库链接的函数
killDbConnections()
#创建数据库连接
con <- dbConnect(MySQL(),host="localhost",dbname="rdb2",user="root",password="")
dbSendQuery(con,'SET NAMES utf8')
rs <- dbSendQuery(con, "SELECT * FROM article WHERE isdone=1")#选中isdone=1的代码，估计就是有内容的。
#涉及到定义函数的学习得比较吃力了，没有相关经验，努力学习呀！
words = data.frame(word=c(), freq = c())#创建一个数据框
while (!dbHasCompleted(rs)) {
chunk <- dbFetch(rs, 10)
#chunk[,4]为title, #chunk[,5]为abstract
count=nrow(chunk)
cnt=1
while(cnt<=count){
str = gsub("[[:punct:]]", "", tolower(chunk[cnt,5]))
temp = as.vector(unlist(strsplit(str, split = " ")))
temp_len = length(temp)
cnt2 = 1
while(cnt2 <= temp_len){
if(temp[cnt2] %in% words$word){
words[words$word == temp[cnt2],]$freq = words[words$word == temp[cnt2],]$freq+1
}
else{
words = rbind(words,data.frame(word=c(temp[cnt2]),freq=c(1)))
}
cnt2 = cnt2+1
}
cnt = cnt +1
}
}
head(words)
#任务2
library(wordcloud2)
wordcloud2(words[0:1000,])
#任务3
#按照freq的降序排列
new_words = words[order(words$freq,decreasing=T),]
#去掉一些定冠词等 of and the
del_word = c('not','two','other','during','of','it','may','the','and','in','to','a','that','is','for','by','with','we','are','an','this','these','as','from','which','at','their','have','or','our','its','but','how','be','as','here','on','can','into','data','between','both','also')
words2 =words[which(!(words$word %in% del_word)),]
wordcloud2(words2)#这个包用法很easy嘛，直接调用就好。
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