ascp下载ebi ncbi数据库大文件

zd00572

Posted by zd200572 on August 9, 2017

ascp下载ebi ncbi数据库大文件

在技能树论坛里看到有人说ascp可以下载宽带满速,就百度了一下,但是发现ncbi的正常可用,ebi的已经不能用了,所以更新一下。

ebi

 ascp -i asperaweb_id_dsa.openssh -Tr -Q -l 6M -P33001 -L- -k1 era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/ERR262/ERR262997/ERR262997_1.fastq.gz H:\ ## 千人基因组计划数据下载代码##
ascp -i asperaweb_id_dsa.openssh -Tr -Q -l 6M -P33001 -L- -k1 fasp-g1k@fasp.1000genomes.ebi.ac.uk:/vol1/ftp/phase3/data/HG00096/high_coverage_alignment/HG00096.wgs.ILLUMINA.bwa.GBR.high_cov_pcr_free.20140203.bam

ncbi

ascp -QT -l 6M -k1 -i asperaweb_id_dsa.openssh anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov://sra/sra-instant/reads/ByExp/sra/SRX/SRX248/SRX248556/SRR771547/SRR771547.sra

下载速度真的真的好快!!!宽带满速是真的,这技术,比迅雷更牛呀! -k1 断点续传的参数

附上说明网页: http://www.internationalgenome.org/faq/how-download-files-using-aspera 参考: http://www.bbioo.com/lifesciences/40-116614-1.html